この部室は帰宅しない部が占拠しました。

私立秋月学園に通う普通の男子高校生・柊木夕也は、学校に忘れた携帯電話を取りに行くために、夜の学校へ忍び込んだ。無事携帯を取り戻した夕也だったが、突如ナイフを持った少女に襲われる。襲いかかってきたのは、転校してきたばかりのクラスメイト・桜江ゆすらだった。この時、既に閉門時間は過ぎていたが、ゆすらをはじめ、夕也の幼馴染・木滝恋子など、数名の生徒が校内に残っており、各々が自らの目的を果たすために、秘密裏に活動を続けていた。

シスコンを克服しつつある柊木夕也率いる帰宅しない部。学園祭を目前に控えた夜の屋上で、美人生徒会長・秋月琴音に告白をされた夕也は、その告白を機に自分の本当の気持ちに気付き始める。夕也に思いを寄せる2人の美少女・桜江ゆすら、木滝恋子らと共に学園祭準備が続く中、覚悟を決めた恋子は、夕也への想いを胸に動き始める。けれど、普段なら張り合ってくるはずのゆすらはどこか思い詰めた様子で...?三者三様の想いを胸に秘めたまま、とうとう学園祭が開催!波乱の末、夕也が選んだ一つの結論とは...?部室で同居な学園ラブコメついに閉室!?